好氧發(fā)酵生產(chǎn)的有機(jī)肥更好，因?yàn)檫@種方式是在無害的條件下，通過微生物對有機(jī)物質(zhì)降解成有機(jī)肥原料的，能消滅部分病原菌和雜草種子，提高肥料的營養(yǎng)價值，好氧發(fā)酵全過程是無臭的，反而有淡淡的泥土味。

      而厭氧發(fā)酵一般會產(chǎn)生對作物不利的物質(zhì)，例如會產(chǎn)生甲烷、乳酸等有機(jī)酸，而甲烷等屬于溫室氣體，會污染空氣，這些有機(jī)酸物質(zhì)會弱化作物的根，因此厭氧發(fā)酵產(chǎn)生的有機(jī)肥的營養(yǎng)價值相對較低，而且厭氧發(fā)酵裝置投資較大，通常容易發(fā)出臭味。

      綜上所述，與厭氧相比，好氧發(fā)酵全過程是無害的，而且有機(jī)肥原料的營養(yǎng)價值高，還能實(shí)現(xiàn)除臭殺菌的目標(biāo)。